Una nueva variante del SARS-CoV-2, Pirola (BA.2.86), se está propagando a nivel mundial y está causando preocupación por su alta tasa de mutación. Los investigadores del Instituto de Inmunología de La Jolla están utilizando una base de datos de epítopos inmunes para predecir las respuestas de las células T a Pirola, y descubrieron que las vacunas existentes y las variantes previamente expuestas, como Omicron, aún brindan una protección significativa. Aunque estos resultados son prometedores, siguen siendo predictivos y requieren una mayor validación experimental.
Los científicos del Instituto de Inmunología de La Jolla utilizaron la bioinformática para predecir cómo se adaptarían las células T para luchar contra las variantes de Pirola altamente mutadas. En agosto, los investigadores detectaron una nueva "variante preocupante" del SARS-CoV-2 en pacientes de Israel y Dinamarca. Desde entonces, la variante, conocida como BA.2.86 o "Pirola", se ha extendido por todo el mundo. La variante Pirola es alarmante porque está muy mutada. De hecho, Pirola no está menos mutada que la variante Omicron en comparación con la variante del SARS-CoV-2 contra la que se vacunó originalmente.
A medida que Pirola se propaga, los investigadores del Instituto de Inmunología de La Jolla (LJI) están investigando si las vacunas COVID-19 (o las vacunas contra el SARS-CoV-2 de exposición previa) aún pueden proteger a las personas de enfermedades graves.
Alessandro Sette, profesor de LJI y Ph.D. en ciencias biológicas, dijo: "A la gente le preocupa que los virus con tantas mutaciones 'escapan' de la inmunidad de las células T".
Ahora, un nuevo estudio publicado en la revista Cell Host & Microbe muestra que las células T pueden ver a través de las mutaciones de Pirola y fijar sus objetivos. "Nuestro análisis arroja noticias positivas", afirmó la Dra. Alba Grifoni, profesora asistente de investigación. "Parece que las personas que han estado expuestas previamente a Omicron o vacunadas con la nueva vacuna bivalente pueden estar armadas con células T que pueden 'ponerse al día' y generar una respuesta específica contra Pirola".
Para el nuevo estudio, Sette y Grifoni aprovecharon un recurso llamado Immune Epitope Database (IEDB). La base de datos contiene investigaciones valiosas recopiladas por inmunólogos de todo el mundo, que describen cómo las células inmunitarias reconocen fragmentos o "epítopos" de los microorganismos.
Utilizando una gran cantidad de datos del IEDB, los investigadores han obtenido una comprensión detallada de cómo se "entrenan" las células T para atacar los epítopos del SARS-CoV-2 mediante las vacunas COVID-19 o mediante una exposición previa al SARS-CoV-2. Los investigadores extrajeron estos datos del IEDB y desarrollaron un sistema bioinformático para predecir cómo responderían estas células T a las variantes de Pirola.
"Modelamos las respuestas de las células T a Pirola basándonos en datos experimentales y predichos de variantes anteriores del SARS-CoV-2", dijo Grifoni.
Los investigadores encontraron que la mayoría de las células T aún podrían atacar los epítopos de Pirola:
En general, el 72% de los fragmentos reconocidos por la respuesta de las células T CD4+ "ayudantes" y el 89% de los epítopos de las células T CD8+ "asesinas" no cambiaron o "permanecieron iguales" entre las variantes.
Los investigadores encontraron menos epítopos de células T conservados en la proteína "Spike" de Pirola, lo cual era de esperar ya que porta la mayor parte de la variación. Sólo el 56% de los epítopos de células T "auxiliares" CD4+ y de los epítopos de células T "asesinas" CD8+ se conservan en esta proteína estructural importante. Este es un problema potencial porque las vacunas actuales contra el COVID-19 están diseñadas para permitir que las células inmunitarias solo reconozcan y se adhieran a los epítopos de Spike.
Sin embargo, cuando los investigadores observaron de cerca el fragmento de Spike, encontraron que el 96% de los epítopos de las células T "auxiliares" CD4+ y el 62% de los epítopos de las células T "asesinas" CD8+ eran tan similares que aún era posible que las células T los reconocieran.
En resumen, si Pirola quiere evadir las células T, no hace un buen trabajo.
"Muchos epítopos reconocidos por el sistema inmunológico permanecen sin cambios en la nueva variante Pirola. Se predice que este virus seguirá siendo reconocido por las células T", dijo Sette.
"También es posible que las células T 'persigan' los péptidos recientemente mutados de Pirola, lanzando nuevas respuestas contra estos epítopos, como hemos visto con otras variantes", añadió Grifoni. "Creemos que esta puede ser una de las razones por las que no vemos una enfermedad más grave en los casos de infección por el virus Pirola u otras variantes recientes, a pesar de la evolución del virus".
Grifoni enfatizó que estos hallazgos son predicciones y no se basan en observaciones de infecciones reales por Pirola. Aún así, cree que es importante ver cómo las observaciones y predicciones se reflejan en investigaciones reales recientes. Todavía necesitamos una validación experimental, pero hemos establecido varias instituciones colaborativas en todo el mundo que están trabajando en este tema.
Sette añadió que muchas personas siguen siendo susceptibles al SARS-COV-2, incluso con la variante Pirola. Por eso la gente debería seguir vacunándose, especialmente las más recientes.
Actualmente, los investigadores están recopilando datos experimentales para comprender mejor las respuestas de las células T a las variantes y mejorar aún más sus herramientas predictivas para comprender cómo las personas que han recibido vacunas bivalentes y/o infecciones "revolucionarias" desarrollarán respuestas de las células T a futuras variantes.
Referencia "Predicción de que las células T específicas del SARS-2 existentes reconocerán de forma cruzada BA.2.86" publicada por Alessandro Sette, John Sidney y Alba Grifoni en la revista Cell Host & Microbe el 8 de diciembre de 2023.
DOI:10.1016/j.chom.2023.11.010
Fuente compilada: ScitechDaily