A las 17:47 hora local del día 2 (16:47 hora de Beijing), un avión de pasajeros de Japan Airlines chocó con un avión de la Guardia Costera después de aterrizar en el aeropuerto Haneda de Tokio esa tarde, provocando un grave incendio.Según los informes, las 379 personas a bordo del vuelo de Japan Airlines escaparon. Cinco personas a bordo del avión de la Guardia Costera de Japón murieron y el capitán resultó gravemente herido.

Se informa que el avión de la Guardia Costera estaba originalmente programado para volar a la zona afectada por el terremoto de Ishikawa para entregar suministros de socorro, pero no siguió las instrucciones de la estación de despacho, lo que provocó que los dos aviones "se estrellaran contra la parte trasera".

El Ministerio de Tierra, Infraestructura, Transporte y Turismo de Japón y la Guardia Costera de Japón celebraron una conferencia de prensa.Se anunció que los funcionarios identificaron la colisión del avión que ocurrió en el aeropuerto Haneda de Tokio ese día como un accidente de aviación y notificaron a la Junta de Seguridad del Transporte de Japón.

En conferencia de prensa realizada por Japan Airlines, el responsable de la compañía dijo,El avión de pasajeros de JAL que chocó ese día con un avión de la Guardia Costera de Japón en el aeropuerto Haneda de Tokio había recibido permiso de aterrizaje del aeropuerto antes del incidente.

La tripulación indicó que la aeronave se acercó a la pista e inició las operaciones de aterrizaje de la misma forma habitual.

Según noticias difundidas por Japan Airlines, afectada por la colisión del avión en el aeropuerto Haneda de Tokio ese día,La compañía canceló un total de 116 vuelos nacionales en Japón el día 2, lo que afectó a aproximadamente 19.920 pasajeros.